| 1 | Andrea IANNONE | Ongetta Team I.S.P.A. | Aprilia | 41'10.494 | |
| 2 | Nicolas TEROL | Jack & Jones Team | Aprilia | 41'12.739 | 2.245 |
| 3 | Sergio GADEA | Bancaja Aspar Team 125cc | Aprilia | 41'12.824 | 2.330 |
| 4 | Julian SIMON | Bancaja Aspar Team 125cc | Aprilia | 41'12.825 | 2.331 |
| 5 | Marc MARQUEZ | Red Bull KTM Moto Sport | KTM | 41'12.850 | 2.356 |
| 6 | Jonas FOLGER | Ongetta Team I.S.P.A. | Aprilia | 41'13.025 | 2.531 |
| 7 | Stefan BRADL | Viessmann Kiefer Racing | Aprilia | 41'21.289 | 10.795 |
| 8 | Bradley SMITH | Bancaja Aspar Team 125cc | Aprilia | 41'21.318 | 10.824 |
| 9 | Sandro CORTESE | Ajo Interwetten | Derbi | 41'25.478 | 14.984 |
| 10 | Randy KRUMMENACHER | Degraaf Grand Prix | Aprilia | 41'25.583 | 15.089 |
| 11 | Scott REDDING | Blusens Aprilia | Aprilia | 41'26.921 | 16.427 |
| 12 | Esteve RABAT | Blusens Aprilia | Aprilia | 41'27.009 | 16.515 |
| 13 | Johann ZARCO | WTR San Marino Team | Aprilia | 41'37.949 | 27.455 |
| 14 | Joan OLIVE | Derbi Racing Team | Derbi | 41'38.206 | 27.712 |
| 15 | Takaaki NAKAGAMI | Ongetta Team I.S.P.A. | Aprilia | 41'38.905 | 28.411 |
| 16 | Simone CORSI | Jack & Jones Team | Aprilia | 41'44.191 | 33.697 |
| 17 | Tomoyoshi KOYAMA | Loncin Racing | Loncin | 41'53.075 | 42.581 |
| 18 | Cameron BEAUBIER | Red Bull KTM Moto Sport | KTM | 41'59.341 | 48.847 |
| 19 | Alberto MONCAYO | Andalucia Aprilia | Aprilia | 42'00.026 | 49.532 |
| 20 | Dominique AEGERTER | Ajo Interwetten | Derbi | 42'00.266 | 49.772 |
| 21 | Jasper IWEMA | Racing Team Germany | Honda | 42'13.160 | 1'02.666 |
| 22 | Sturla FAGERHAUG | Red Bull KTM Moto Sport | KTM | 42'25.709 | 1'15.215 |
| 23 | Johnny ROSELL | Blusens BQR | Aprilia | 42'32.062 | 1'21.568 |
| 24 | Luca MARCONI | CBC Corse | Aprilia | 42'48.413 | 1'37.919 |
| 25 | Jordi DALMAU | SAG-Castrol | Honda | 41'47.580 | 1 Lap |
| 26 | Luca VITALI | CBC Corse | Aprilia | 42'12.575 | 2 Lap |
| 1 | Alvaro BAUTISTA | Mapfre Aspar Team | Aprilia | 41'09.018 | |
| 2 | Hiroshi AOYAMA | Scot Racing Team 250cc | Honda | 41'16.203 | 7.185 |
| 3 | Hector BARBERA | Pepe World Team | Aprilia | 41'16.300 | 7.282 |
| 4 | Mattia PASINI | Team Toth Aprilia | Aprilia | 41'19.802 | 10.784 |
| 5 | Alex DEBON | Aeropuerto-Castello-Blusens | Aprilia | 41'24.758 | 15.740 |
| 6 | Thomas LUTHI | Emmi - Caffe Latte | Aprilia | 41'24.798 | 15.780 |
| 7 | Ratthapark WILAIROT | Thai Honda PTT SAG | Honda | 41'37.672 | 28.654 |
| 8 | Karel ABRAHAM | Cardion AB Motoracing | Aprilia | 41'40.618 | 31.600 |
| 9 | Raffaele DE ROSA | Scot Racing Team 250cc | Honda | 41'42.778 | 33.760 |
| 10 | Hector FAUBEL | Valencia CF - Honda SAG | Honda | 41'42.861 | 33.843 |
| 11 | Jules CLUZEL | Matteoni Racing | Aprilia | 41'43.889 | 34.871 |
| 12 | Lukas PESEK | Auto Kelly - CP | Aprilia | 41'44.135 | 35.117 |
| 13 | Alex BALDOLINI | WTR San Marino Team | Aprilia | 41'48.858 | 39.840 |
| 14 | Mike DI MEGLIO | Mapfre Aspar Team 250cc | Aprilia | 41'51.839 | 42.821 |
| 15 | Stevie BONSEY | Milar - Juegos Lucky | Aprilia | 42'25.542 | 1'16.524 |
| 16 | Axel PONS | Pepe World Team | Aprilia | 42'25.707 | 1'16.689 |
| 17 | Valentin DEBISE | CIP Moto - GP250 | Honda | 42'37.844 | 1'28.826 |
| 18 | Balazs NEMETH | Balatonring Team | Aprilia | 42'48.506 | 1'39.488 |
| 19 | Bastien CHESAUX | Racing Team Germany | Honda | 42'56.976 | 1'47.958 |
| 20 | Vladimir LEONOV | Viessmann Kiefer Racing | Aprilia | 41'34.233 | 1 Lap |
| 21 | Toby MARKHAM | C&L Racing | Honda | 41'46.384 | 1 Lap |
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